بالرغم من تصنيف "آيفون 16e" على أنه أرخص هواتف سلسلة "16" من "أبل" إلا أنه يفتقر إلى الكثير من المزايا مقارنة مع باقي هواتف السلسلة؛ لأنه لا يدعم ميزة "MagSafe" أو ما يعرف بشحن الأجهزة لا سلكيا. كما أنه يأتي بكاميرا واحدة وبدقة 48 "ميغابكسل" على عكس الطرزات الأخرى التي تتوفر فيها على الأقل كاميرتان.
ولا يحتوي الهاتف الرخيص على زر التحكم في الكاميرا، كما أنه لا يدعم يزة "العثور الدقيق" المستخدمة مع أجهزة "AirTag" للعثور على الأشياء المفقودة. ويضاف إلى ذلك أنه لا يوجد به مكان لبطاقة "SIM" في الهواتف المبيعة بأسواق الولايات المتحدة لذا سيحتاج المستخدم إلى استخدام "eSIM" بينما ستكون متوفرة في باقي بلدان العالم.